190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0145 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0145  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
437 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4568  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.364074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  35.23 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  31.06 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  36.26 
 
 
278 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  31.82 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  25.3 
 
 
278 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  27.74 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
278 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  23.53 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0315  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0142975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 
323 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  35.35 
 
 
320 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  28 
 
 
322 aa  54.7  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  34.12 
 
 
310 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
278 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  30.77 
 
 
318 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0320  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
317 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
278 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  33.72 
 
 
345 aa  53.9  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  31.3 
 
 
310 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  31.3 
 
 
310 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  23.93 
 
 
273 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  34.12 
 
 
310 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  27.7 
 
 
317 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  30.43 
 
 
310 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  32.94 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  34.12 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  32.11 
 
 
301 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  31.3 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  36.59 
 
 
316 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  35.29 
 
 
314 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
330 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  32.11 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
273 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  27.97 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
294 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  28.57 
 
 
325 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0303  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.136921  hitchhiker  0.000000724051 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  31.63 
 
 
317 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  31.63 
 
 
317 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
338 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  28.68 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
283 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
275 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  31.82 
 
 
310 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  34.09 
 
 
323 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.59 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  30.34 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  30.59 
 
 
313 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
324 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  28.37 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  29.03 
 
 
287 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.18 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  21.82 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
320 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  32.53 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
282 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  29.91 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  27.34 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  29.36 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  28.44 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
324 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
292 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  27.03 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  30.34 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  24.32 
 
 
273 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
278 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  28.57 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  26.87 
 
 
317 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
276 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  27.97 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  32.67 
 
 
329 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
273 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  30.61 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
271 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  32.53 
 
 
333 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  28.18 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
270 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  30 
 
 
320 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  27.27 
 
 
312 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29 
 
 
319 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
273 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  27.27 
 
 
312 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  27.27 
 
 
312 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2257  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
412 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>