28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3839 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  33.52 
 
 
179 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  30.57 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  32.5 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  30.85 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  33.95 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  28.65 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  27.59 
 
 
178 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  30.43 
 
 
172 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  26.15 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  28.5 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  29.67 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  26.44 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  29.01 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  26.83 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  26.09 
 
 
181 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  25.99 
 
 
187 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  28.74 
 
 
177 aa  62.4  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  25.9 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  24.06 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  23.83 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  26.16 
 
 
180 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  22.36 
 
 
184 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  23.31 
 
 
184 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  22.36 
 
 
187 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  21.95 
 
 
184 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  24.35 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  28.18 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>