More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4223 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  64.62 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  63.4 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  59.9 
 
 		 202 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  60.2 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  59.69 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  59.9 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  59.39 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  59.39 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  59.39 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  55.84 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  56.85 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  56.85 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  59.18 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  59.18 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  59.18 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  59.18 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  59.18 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  58.67 
 
 		 203 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  53.3 
 
 		 203 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  58.16 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  55.1 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  52 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  52.58 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3683  dephospho-CoA kinase  54.4 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  49.49 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0802  dephospho-CoA kinase  51.83 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.626874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0765  dephospho-CoA kinase  51.31 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  49.24 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  49.75 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  47.42 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  48.24 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  50.51 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  52.94 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  50.49 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  51.49 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  48.48 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  51.87 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  49.23 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  46.67 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2433  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 296 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  45.6 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  38.78 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  47.09 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  47.4 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  46.11 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  41.03 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  43.3 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  44.67 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  47.98 
 
 		 354 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  45.71 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  46.55 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  39.38 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  46.86 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  45.71 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  45.71 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 		 306 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13000  dephospho-CoA kinase  42.42 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  41.75 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  40.8 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  42.31 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  38.81 
 
 		 402 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  39.38 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  43.92 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  39.38 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  42.78 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  37.76 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  42.29 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  42.29 
 
 		 404 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  44.22 
 
 		 394 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  38.86 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  38.86 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  41.3 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  44.27 
 
 		 392 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  38.86 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  40.31 
 
 		 410 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>