More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5520 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  100 
 
 
394 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  59.33 
 
 
402 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  52.81 
 
 
402 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  49.5 
 
 
407 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  50.51 
 
 
410 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  50.79 
 
 
404 aa  328  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  51.01 
 
 
430 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  56.1 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  50.26 
 
 
404 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  46.94 
 
 
385 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  46.94 
 
 
385 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  51.81 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  46.55 
 
 
385 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  55.07 
 
 
354 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3139  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  54.08 
 
 
338 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2433  dephospho-CoA kinase  55.08 
 
 
296 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
306 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2943  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  53.07 
 
 
319 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  60.91 
 
 
198 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  57.81 
 
 
213 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  57.29 
 
 
210 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 
200 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2971  Dephospho-CoA kinase  56.77 
 
 
202 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13000  dephospho-CoA kinase  52.5 
 
 
200 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1520  dephospho-CoA kinase  53.88 
 
 
212 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  51.83 
 
 
206 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
200 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  48.22 
 
 
215 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  52.54 
 
 
196 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
195 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20170  dephospho-CoA kinase  52.06 
 
 
207 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  48.45 
 
 
229 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5666  dephospho-CoA kinase  50.75 
 
 
209 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  0.0403598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1959  dephospho-CoA kinase  52.2 
 
 
209 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  40 
 
 
205 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0744  dephospho-CoA kinase  40.82 
 
 
205 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0276595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  44.21 
 
 
204 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  41.12 
 
 
207 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  39.29 
 
 
206 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  44.22 
 
 
201 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  44.33 
 
 
211 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  42.33 
 
 
211 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2074  dephospho-CoA kinase  38.07 
 
 
203 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000294948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  36.55 
 
 
201 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
201 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  43.3 
 
 
211 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
211 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  40.82 
 
 
201 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  38.94 
 
 
218 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  38.17 
 
 
205 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2732  dephospho-CoA kinase  45.23 
 
 
221 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496123  decreased coverage  0.00115586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  38.91 
 
 
212 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  36.79 
 
 
215 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  34.54 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0757  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 
211 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  39.78 
 
 
204 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 
210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 
207 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2418  dephospho-CoA kinase  34.18 
 
 
200 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0117806 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0605  dephospho-CoA kinase  33.18 
 
 
234 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  45.6 
 
 
210 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 
205 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 
202 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 
206 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  40.84 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0885  dephospho-CoA kinase  35.71 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  36.56 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2343  dephospho-CoA kinase  40.78 
 
 
210 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00562269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
203 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  36.56 
 
 
205 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  36.95 
 
 
204 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  36.82 
 
 
204 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2014  dephospho-CoA kinase  34.57 
 
 
196 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
220 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1091  dephospho-CoA kinase  47.86 
 
 
224 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.226382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  37.69 
 
 
204 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
206 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  35.68 
 
 
204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  35.68 
 
 
204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  36.26 
 
 
199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2356  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000670117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  42.94 
 
 
204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  40.94 
 
 
203 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  39.23 
 
 
199 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>