More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2708 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 204 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  99.51 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  87.25 
 
 		 204 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  65.52 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  63.55 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  60.4 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  60.4 
 
 		 202 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  59.9 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  58.91 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  58.91 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  58.91 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  61.2 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  61.75 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  63.39 
 
 		 202 aa  210  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  56.44 
 
 		 203 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  56.37 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  55.39 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  55.88 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  54.77 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  56.78 
 
 		 204 aa  195  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  48.98 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 204 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  56.11 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  55.38 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  46.77 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  50.74 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  46.73 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  56.92 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  50.49 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  44.72 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  51.85 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 		 204 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  44.72 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  46.53 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  44.81 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  45.11 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  45.11 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  43.35 
 
 		 212 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  46.94 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  52.26 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  42.5 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  39.7 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  39.7 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  46.31 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0066  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000029391  normal  0.557904 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  41.41 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  41.41 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  41.41 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  41.41 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3683  dephospho-CoA kinase  52.78 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  39.2 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.69 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  41.75 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0061  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 		 230 aa  140  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000202187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  39.7 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  42.5 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  38.69 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  43.75 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  45.16 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  43.65 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04889  dephospho-CoA kinase  42.57 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>