More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0366 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  42.42 
 
 
205 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  42.42 
 
 
205 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  50.8 
 
 
204 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  46.67 
 
 
201 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  46.03 
 
 
214 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
205 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  41.41 
 
 
205 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  49.5 
 
 
207 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 
208 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  46 
 
 
208 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
204 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 
202 aa  158  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  43.88 
 
 
207 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  41.21 
 
 
205 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 
205 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 
204 aa  157  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  43.32 
 
 
204 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  44.56 
 
 
216 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  42.25 
 
 
205 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  45.69 
 
 
208 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  48.47 
 
 
202 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  46.89 
 
 
202 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 
205 aa  154  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 
204 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 
204 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  45.69 
 
 
208 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
202 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  43.72 
 
 
204 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 
206 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 
204 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 
205 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  43.63 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  46.94 
 
 
202 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  47.45 
 
 
202 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  46.82 
 
 
208 aa  151  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  43.14 
 
 
206 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
203 aa  148  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  44.92 
 
 
203 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  43.14 
 
 
206 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  43.14 
 
 
206 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  43.14 
 
 
206 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  39.29 
 
 
201 aa  147  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  39.7 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  40 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  43.98 
 
 
204 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  42.65 
 
 
206 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
201 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  43.16 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
207 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
200 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
207 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  44.81 
 
 
207 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 
198 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 
206 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  40.96 
 
 
206 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 
206 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 
207 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  44.2 
 
 
206 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  46.37 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  46.89 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  46.37 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  44.22 
 
 
203 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  45.81 
 
 
203 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
207 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  43.55 
 
 
229 aa  141  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  47.98 
 
 
200 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 
211 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  43.3 
 
 
200 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  38.07 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  38.5 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  43.41 
 
 
203 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2684  dephospho-CoA kinase  49.73 
 
 
205 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00367316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  46.63 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  44.15 
 
 
202 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
216 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  40.82 
 
 
196 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  38 
 
 
201 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  46.5 
 
 
211 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  37.77 
 
 
202 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  42.31 
 
 
203 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>