More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0413 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  88.78 
 
 
205 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  88.78 
 
 
205 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  88.29 
 
 
205 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  85.37 
 
 
205 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  84.88 
 
 
205 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  84.88 
 
 
205 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  84.88 
 
 
205 aa  360  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  85.37 
 
 
205 aa  353  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  67.8 
 
 
205 aa  284  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  69.35 
 
 
201 aa  283  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  68 
 
 
201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  60.5 
 
 
201 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  64.8 
 
 
209 aa  258  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  62.5 
 
 
201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  60.82 
 
 
206 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  55.28 
 
 
204 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  53.85 
 
 
204 aa  217  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  50.99 
 
 
204 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  51.79 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  51.79 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  51.28 
 
 
206 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  52.55 
 
 
202 aa  206  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
206 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
208 aa  204  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
206 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
206 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
206 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
206 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  48.02 
 
 
207 aa  201  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  48.22 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  49.75 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  47.26 
 
 
202 aa  194  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  47.76 
 
 
207 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  47.72 
 
 
208 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2633  dephospho-CoA kinase (dephosphocoenzyme a kinase)  51.02 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  48.22 
 
 
203 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  47.72 
 
 
203 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
207 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
207 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  48.5 
 
 
202 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  44.78 
 
 
207 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
208 aa  184  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3341  dephospho-CoA kinase  51.26 
 
 
204 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
207 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  47.24 
 
 
202 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 
207 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  47.96 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  44.22 
 
 
202 aa  177  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
207 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 
207 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  43.72 
 
 
216 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  46.94 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  45.81 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  44.62 
 
 
212 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 
200 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
200 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  44.9 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  46.39 
 
 
203 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 
200 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 
202 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  47.69 
 
 
202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2106  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
207 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2684  dephospho-CoA kinase  49.49 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00367316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  45.18 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  45.18 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  45.18 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  44.67 
 
 
202 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
197 aa  160  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2028  dephospho-CoA kinase  45.05 
 
 
207 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  41.15 
 
 
203 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.56 
 
 
203 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 
203 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  45.13 
 
 
199 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  41.38 
 
 
216 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 
210 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  40.59 
 
 
204 aa  158  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  45.13 
 
 
199 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  42.49 
 
 
200 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>