More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3709 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  61.66 
 
 
204 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  59.09 
 
 
202 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
202 aa  227  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
202 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
202 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
202 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
202 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  58.88 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  56.93 
 
 
208 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  58.38 
 
 
200 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  56.06 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  53.73 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  56.57 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
202 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 
200 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  58.59 
 
 
203 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
203 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
203 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
203 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
203 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 
203 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  57.58 
 
 
203 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
200 aa  205  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  50.49 
 
 
206 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  55.28 
 
 
204 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  54.77 
 
 
204 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  53.77 
 
 
204 aa  194  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  51.28 
 
 
201 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  44.78 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  55.93 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  46 
 
 
205 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  46.57 
 
 
204 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  46.73 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
205 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 
207 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  46 
 
 
205 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 
205 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  54.4 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  45 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
202 aa  177  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
205 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  44.28 
 
 
209 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  52.58 
 
 
201 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
208 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  51.7 
 
 
203 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  45.85 
 
 
201 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
205 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  47.47 
 
 
202 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0066  dephospho-CoA kinase  42.79 
 
 
230 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000029391  normal  0.557904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  45 
 
 
207 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  45 
 
 
207 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0061  dephospho-CoA kinase  43.28 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000202187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  45.92 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  42.57 
 
 
204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.95 
 
 
203 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
216 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  44.9 
 
 
215 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  47.76 
 
 
203 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  48.02 
 
 
207 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  40.61 
 
 
206 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  40.61 
 
 
206 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  40.61 
 
 
206 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  45.64 
 
 
207 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  44.62 
 
 
203 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  44.1 
 
 
207 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  41.09 
 
 
204 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  53.11 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  44.62 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  42 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  40.1 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  41 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
199 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  47.15 
 
 
210 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  41.5 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 
201 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  43.08 
 
 
216 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  40.1 
 
 
201 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  40.4 
 
 
206 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 
207 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  41.79 
 
 
208 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>