More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3786 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  64.29 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  64.29 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  64.8 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  64.29 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  65.33 
 
 		 205 aa  265  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  65.82 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  64.8 
 
 		 205 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  60.3 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  65.31 
 
 		 205 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  64.8 
 
 		 205 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  64.8 
 
 		 205 aa  258  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  58.88 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  61.42 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  55.56 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  56.48 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  56.48 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  56.77 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  54.31 
 
 		 206 aa  217  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  52.55 
 
 		 204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  53.3 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  52.31 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  52.31 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  52.94 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  52.31 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  48.78 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2633  dephospho-CoA kinase (dephosphocoenzyme a kinase)  53.89 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  49.21 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  47.96 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  46.39 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  44.1 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  45.27 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  46.39 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  44.28 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  44.85 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.96 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  45.41 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  44.9 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3341  dephospho-CoA kinase  45.99 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  44.9 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  43.94 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  47.94 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  45.92 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  46 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  44.85 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  44.33 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  42.57 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2684  dephospho-CoA kinase  47.98 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00367316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  44.62 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  42.19 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  40.8 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0066  dephospho-CoA kinase  41.79 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000029391  normal  0.557904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0061  dephospho-CoA kinase  41.79 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000202187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  46.91 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  46.91 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  44.79 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  42.27 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  42.27 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  44.07 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  43.5 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  40.1 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  44.07 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  43.65 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>