More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0366 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  67.32 
 
 
205 aa  290  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  66.83 
 
 
205 aa  288  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  69 
 
 
201 aa  286  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  66.83 
 
 
205 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  67.8 
 
 
205 aa  284  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  67.32 
 
 
205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  65.85 
 
 
205 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  65.85 
 
 
205 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  65.85 
 
 
205 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  66.83 
 
 
205 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  65.83 
 
 
201 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  65.33 
 
 
209 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  62.63 
 
 
201 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  62.76 
 
 
206 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  60.61 
 
 
201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  60.2 
 
 
204 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  58.16 
 
 
204 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  56.63 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
206 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
206 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  52.48 
 
 
207 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  50.5 
 
 
204 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
206 aa  208  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  52.26 
 
 
208 aa  207  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  51.27 
 
 
208 aa  201  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  53.27 
 
 
202 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  51.27 
 
 
208 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
206 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
206 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
206 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  48.76 
 
 
207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  48.76 
 
 
207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  49.49 
 
 
206 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  56.65 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  50.76 
 
 
202 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  53.81 
 
 
208 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  49.24 
 
 
202 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
203 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 
203 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  48.74 
 
 
207 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2633  dephospho-CoA kinase (dephosphocoenzyme a kinase)  53 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  48.24 
 
 
207 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  47.21 
 
 
207 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  45.05 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 
207 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  45.54 
 
 
207 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.21 
 
 
203 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  44.78 
 
 
202 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  48.24 
 
 
202 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 
202 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  46.46 
 
 
216 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  46.63 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  47.24 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3341  dephospho-CoA kinase  48.65 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  46.73 
 
 
202 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  46.73 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  46.73 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 
202 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  46.31 
 
 
203 aa  167  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  45.16 
 
 
200 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  46.39 
 
 
201 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  45.23 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  42.41 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  45.05 
 
 
210 aa  164  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  44.28 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  44.21 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  46.23 
 
 
203 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  44.09 
 
 
200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  44.62 
 
 
200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  45.73 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  42.16 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 
204 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  44.67 
 
 
198 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
200 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  45.23 
 
 
203 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  43.22 
 
 
200 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>