More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3111 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  78.11 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  63.55 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  63.55 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  63.05 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  62.87 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  64.14 
 
 		 202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  63.13 
 
 		 202 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  63.13 
 
 		 202 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  63.64 
 
 		 202 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  61.88 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  62.12 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  62.63 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  59 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  57.43 
 
 		 200 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  63.33 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  56.06 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  62.43 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  51.58 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  51.31 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  53.33 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  52.02 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  48.76 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  48.1 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  47.55 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  43.48 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  58.89 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  47.57 
 
 		 201 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  45.45 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  43.75 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  43.94 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  43.94 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  41.75 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  45.28 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  43 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  43 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  40.93 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  42.27 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  44 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  42 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.5 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  42 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  46.03 
 
 		 204 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  46.03 
 
 		 204 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  41.79 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  42.65 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  43.43 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  44.78 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  43.94 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  48.47 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  42 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  40.4 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  46.27 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  44.06 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  40.4 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2106  dephospho-CoA kinase  39.71 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2028  dephospho-CoA kinase  39.71 
 
 		 207 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3683  dephospho-CoA kinase  48.19 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  45.88 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  42.42 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  39.7 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  44.74 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  39.2 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>