More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2905 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  61.93 
 
 
203 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  62.19 
 
 
207 aa  235  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  54.55 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  51.92 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  54.04 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  57.69 
 
 
203 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  56.59 
 
 
203 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
203 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
203 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
203 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
203 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
203 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  53.3 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  51.49 
 
 
202 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  53.71 
 
 
206 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  53.61 
 
 
200 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  51.49 
 
 
202 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  51.49 
 
 
202 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  51.76 
 
 
202 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  52.78 
 
 
214 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  51.79 
 
 
200 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  55.38 
 
 
204 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  52.41 
 
 
204 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
201 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  55.38 
 
 
204 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
207 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3683  dephospho-CoA kinase  54.55 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0802  dephospho-CoA kinase  55.05 
 
 
207 aa  181  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.626874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  50.5 
 
 
210 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  53.11 
 
 
207 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0765  dephospho-CoA kinase  54.04 
 
 
197 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  46.97 
 
 
208 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  53.97 
 
 
204 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  55.33 
 
 
214 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0547  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
204 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  47.47 
 
 
201 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  46.33 
 
 
200 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  44.51 
 
 
197 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  42.56 
 
 
216 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  44.57 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  44.57 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  45.36 
 
 
202 aa  144  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  45.76 
 
 
208 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  43.18 
 
 
207 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  44 
 
 
206 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  42.05 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  44 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  45.55 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  41.38 
 
 
207 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  41.38 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  41.87 
 
 
207 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 
208 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  41.87 
 
 
207 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  46.59 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  39.34 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  39.34 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  38.8 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  39.34 
 
 
200 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  46.59 
 
 
206 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  46.59 
 
 
206 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  46.59 
 
 
206 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  39.13 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 
200 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  38.8 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  38.59 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  38.25 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  46.02 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  42.01 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
206 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  45.51 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  43.5 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  36.95 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  45.25 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
205 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  39.39 
 
 
207 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  40.45 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  41.14 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  39.69 
 
 
202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04889  dephospho-CoA kinase  42.62 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>