More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0594 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
197 aa  393  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  44.97 
 
 
205 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  48.15 
 
 
201 aa  161  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
201 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 
205 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 
205 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 
205 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 
205 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 
215 aa  148  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  44.56 
 
 
216 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  42.56 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  42.49 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.19 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  41.67 
 
 
200 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
201 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
200 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
200 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
198 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
207 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 
209 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  37.82 
 
 
204 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  43.68 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  41.45 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  42.7 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  40.41 
 
 
202 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  43.02 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  41.8 
 
 
202 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  44.51 
 
 
212 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  46.03 
 
 
199 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 
214 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
207 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 
210 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  43.78 
 
 
204 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
206 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
206 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 
201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  41.8 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  42.47 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  40.5 
 
 
202 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
206 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  40.41 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  40.41 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  40.88 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
202 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
202 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  40.33 
 
 
203 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  40.93 
 
 
208 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  42.49 
 
 
208 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  38.02 
 
 
200 aa  130  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  37.95 
 
 
204 aa  130  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  41.45 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  41.44 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  43.86 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  37.91 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  39.36 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  39.78 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  41.44 
 
 
204 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3605  dephospho-CoA kinase  41.67 
 
 
195 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.934183  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  39.58 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2501  dephospho-CoA kinase  41.15 
 
 
195 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  39.15 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  37.44 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  35.08 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  36.32 
 
 
200 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  36.84 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  36.84 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  36.84 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  39.38 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  38.1 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  39.33 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  45.58 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>