More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03472 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03472  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
204 aa  413  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002542  dephospho-CoA kinase  92.65 
 
 
204 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000291324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  66.34 
 
 
202 aa  271  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  60.2 
 
 
205 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  58.16 
 
 
205 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  56.63 
 
 
205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
205 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
205 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  56.48 
 
 
209 aa  228  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  55.28 
 
 
205 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
205 aa  227  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  52.94 
 
 
204 aa  225  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2633  dephospho-CoA kinase (dephosphocoenzyme a kinase)  58.79 
 
 
207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  53.5 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  55 
 
 
208 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  52.76 
 
 
201 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0157  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  53.03 
 
 
201 aa  214  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0160  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0153  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  54.08 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0154  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00343706  normal  0.0126579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0152  dephospho-CoA kinase  52.5 
 
 
206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  54.27 
 
 
208 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  51.01 
 
 
206 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  51.01 
 
 
206 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  51.01 
 
 
206 aa  207  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  51.01 
 
 
208 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0459  dephospho-CoA kinase  49.75 
 
 
215 aa  198  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  50.77 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  47.96 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4450  dephospho-CoA kinase  50.75 
 
 
202 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  48.21 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
203 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
203 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3341  dephospho-CoA kinase  49.72 
 
 
204 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  47.18 
 
 
202 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  46.67 
 
 
207 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  46.15 
 
 
207 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0514  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 
203 aa  174  9e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  45.64 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  42.57 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  45.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  45.64 
 
 
207 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  45.13 
 
 
207 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  48.59 
 
 
198 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
202 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  44.1 
 
 
201 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  45.31 
 
 
203 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 
202 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  45.23 
 
 
203 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  45.64 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
201 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  46.39 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  47.22 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  47.22 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  44.72 
 
 
215 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
201 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  47.03 
 
 
200 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
202 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  44.72 
 
 
201 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
203 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  44.95 
 
 
210 aa  158  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 
202 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 
202 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  46.67 
 
 
200 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
216 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  43.94 
 
 
203 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 
202 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
199 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2028  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 
207 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2106  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 
207 aa  154  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2684  dephospho-CoA kinase  48.21 
 
 
205 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00367316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 
202 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  43.08 
 
 
202 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  44.33 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
203 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  45 
 
 
200 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2226  dephospho-CoA kinase  37.88 
 
 
202 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000129832  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  43.59 
 
 
203 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>