More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1625 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
229 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  66.15 
 
 
206 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  55.15 
 
 
198 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  50.96 
 
 
213 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  51.42 
 
 
395 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 
210 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  55.05 
 
 
200 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  54.21 
 
 
196 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  54.08 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  48.31 
 
 
392 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1091  dephospho-CoA kinase  56.02 
 
 
224 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.226382  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2433  dephospho-CoA kinase  46.84 
 
 
296 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  49 
 
 
402 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2971  Dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
202 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  48.68 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  49.74 
 
 
430 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13000  dephospho-CoA kinase  47.4 
 
 
200 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  45.6 
 
 
404 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2943  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  50 
 
 
319 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  45.5 
 
 
306 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  44.34 
 
 
407 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5666  dephospho-CoA kinase  52.53 
 
 
209 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  0.0403598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  45.03 
 
 
385 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  45.03 
 
 
385 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  45.03 
 
 
385 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  48.45 
 
 
394 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1520  dephospho-CoA kinase  49.22 
 
 
212 aa  154  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  48.98 
 
 
201 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  45.26 
 
 
404 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1959  dephospho-CoA kinase  49.49 
 
 
209 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  48.22 
 
 
211 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  43.3 
 
 
410 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  40.74 
 
 
402 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3139  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  48.45 
 
 
338 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  51.81 
 
 
354 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  42.78 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  42.64 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  44.04 
 
 
208 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  40 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2418  dephospho-CoA kinase  40.7 
 
 
200 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0117806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
208 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  43.88 
 
 
212 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  47.72 
 
 
207 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
214 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  37.69 
 
 
317 aa  141  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  45.77 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0744  dephospho-CoA kinase  43.56 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0276595  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20170  dephospho-CoA kinase  46.94 
 
 
207 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  47.24 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 
207 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  45.77 
 
 
211 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  43.72 
 
 
203 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  43.5 
 
 
204 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  37.76 
 
 
201 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  45.56 
 
 
197 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  40.72 
 
 
205 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 
201 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
200 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  41.55 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  39.69 
 
 
206 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  46.19 
 
 
210 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2014  dephospho-CoA kinase  38.3 
 
 
196 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  44.39 
 
 
204 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  45.92 
 
 
202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
216 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 
210 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  41.75 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  42.13 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  43.55 
 
 
204 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 
202 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  43.55 
 
 
204 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 
202 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  46.02 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 
202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  41.84 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  43.78 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2082  dephospho-CoA kinase  39.29 
 
 
216 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.450146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5491  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305341  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  37.07 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  38.86 
 
 
209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 
202 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  44.16 
 
 
202 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0648  dephospho-CoA kinase  41.57 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.241975  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  41.62 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  45.08 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 
205 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  43.65 
 
 
202 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>