More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0605 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0605  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0744  dephospho-CoA kinase  47 
 
 
205 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0276595  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13000  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 
200 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.96 
 
 
402 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  35.68 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  36.97 
 
 
196 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.97 
 
 
354 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  39.7 
 
 
402 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1520  dephospho-CoA kinase  34.76 
 
 
212 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  33.18 
 
 
198 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  38.19 
 
 
410 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.68 
 
 
430 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.89 
 
 
385 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.89 
 
 
385 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.89 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.27 
 
 
407 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  33.02 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.07 
 
 
404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.18 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2433  dephospho-CoA kinase  38.19 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20170  dephospho-CoA kinase  36.04 
 
 
207 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  33.95 
 
 
199 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  31.62 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  31.19 
 
 
229 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.75 
 
 
404 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  30.18 
 
 
205 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  31.7 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  33.83 
 
 
306 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  32.11 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  30.52 
 
 
211 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
211 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  31.43 
 
 
200 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  30.52 
 
 
211 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  34.85 
 
 
201 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2971  Dephospho-CoA kinase  34.76 
 
 
202 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
210 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0282  dephospho-CoA kinase  33.8 
 
 
196 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11170  dephospho-CoA kinase  30.14 
 
 
789 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.901477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3790  dephospho-CoA kinase  31.94 
 
 
203 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.238662  normal  0.41391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  32.11 
 
 
205 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3605  dephospho-CoA kinase  32.56 
 
 
195 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.934183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3172  dephospho-CoA kinase  32.41 
 
 
200 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  33.81 
 
 
395 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  30.7 
 
 
317 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1959  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 
209 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  32.11 
 
 
200 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3459  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 
201 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2501  dephospho-CoA kinase  32.56 
 
 
195 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
200 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
200 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  30.52 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
200 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
206 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  29.15 
 
 
202 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  31.46 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  31.02 
 
 
207 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  30.73 
 
 
201 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0885  dephospho-CoA kinase  31.31 
 
 
195 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  30.52 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  28.64 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  27.98 
 
 
207 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  29.58 
 
 
200 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2943  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32 
 
 
319 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  30.99 
 
 
200 aa  99  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  30.65 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0244  dephospho-CoA kinase  34.31 
 
 
199 aa  98.6  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1954  dephospho-CoA kinase  34.31 
 
 
199 aa  98.6  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1252  dephospho-CoA kinase  30.77 
 
 
203 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.324295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41000  Dephospho-CoA kinase (Dephosphocoenzyme A kinase) (COAE)  34.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.495473  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  30.52 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2343  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00562269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0362  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  31.16 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0692  dephospho-CoA kinase  30.7 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  30.62 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2074  dephospho-CoA kinase  33.95 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000294948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.52 
 
 
392 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  28.1 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  32.67 
 
 
196 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  30.58 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4423  dephospho-CoA kinase  27.6 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  32.54 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2418  dephospho-CoA kinase  30.24 
 
 
200 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0117806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  32.16 
 
 
201 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3139  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.28 
 
 
338 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2014  dephospho-CoA kinase  28.16 
 
 
196 aa  91.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0883  dephospho-CoA kinase  33.17 
 
 
201 aa  91.7  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5666  dephospho-CoA kinase  28.77 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  0.0403598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  31.02 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2356  dephospho-CoA kinase  31.19 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  28.64 
 
 
204 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  28.77 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  29.58 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1745  dephospho-CoA kinase  30.96 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00501  dephospho-CoA kinase  28.64 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1779  dephospho-CoA kinase  30.96 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.893439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  30.1 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  31.6 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>