More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3015 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  867    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  47.33 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  47.57 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  41.98 
 
 		 420 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  37.2 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.89 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  37.05 
 
 		 424 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  40.25 
 
 		 414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  37.2 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  37.78 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  37.53 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  39.57 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  34.56 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  38.48 
 
 		 420 aa  257  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  34.24 
 
 		 429 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  35.87 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  35.71 
 
 		 448 aa  252  9.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.89 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  34.22 
 
 		 468 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 439 aa  245  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  34.23 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  33.5 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  32.21 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  31.01 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  35.24 
 
 		 422 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  32.39 
 
 		 442 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.92 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.92 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  31 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.1 
 
 		 447 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  38.02 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  32.04 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.58 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  35.19 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  31.95 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  34.14 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  35.85 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.25 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.29 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.46 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.24 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  32.08 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.24 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  34.63 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 		 442 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.6 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.37 
 
 		 442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.72 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  31.94 
 
 		 429 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  32.44 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.13 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.37 
 
 		 442 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  33.18 
 
 		 441 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.37 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.13 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  32.92 
 
 		 412 aa  225  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  31.23 
 
 		 523 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  30.39 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.63 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  30.07 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.63 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  31.1 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  30.62 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 		 432 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  28.77 
 
 		 440 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.47 
 
 		 454 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  31.69 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  32.58 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  31.46 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  33.16 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  32.16 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  30.55 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  31.09 
 
 		 439 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  29.67 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31.69 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  31.69 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  30.62 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  31.69 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  29.1 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.46 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  30.6 
 
 		 429 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  31.36 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  28.71 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  30.88 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  28.92 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  30.68 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>