More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2457 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2457  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
517 aa  1065    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000591951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  51.54 
 
 
511 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  51.93 
 
 
511 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  48.65 
 
 
514 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.74 
 
 
509 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1412  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.66 
 
 
517 aa  422  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1279  cardiolipin synthetase  43.61 
 
 
449 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.624146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1054  cardiolipin synthetase  42.2 
 
 
531 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.549629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.26 
 
 
530 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1331  phospholipase D/transphosphatidylase  38.24 
 
 
519 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000112238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  33.74 
 
 
514 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  33.81 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  33.74 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  33.27 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 
514 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
502 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
509 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  32.82 
 
 
502 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
509 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
509 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 
509 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
509 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  30.06 
 
 
509 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.65 
 
 
509 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 
509 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.67 
 
 
487 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.56 
 
 
541 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 
494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 
494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.92 
 
 
488 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 
485 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.17 
 
 
499 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.75 
 
 
482 aa  233  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.15 
 
 
484 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  30.32 
 
 
490 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
483 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.94 
 
 
463 aa  230  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  31.36 
 
 
483 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.39 
 
 
472 aa  227  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.31 
 
 
505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.31 
 
 
505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.63 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.62 
 
 
508 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  32.03 
 
 
470 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.78 
 
 
492 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl626  cardiolipin synthetase  28.27 
 
 
521 aa  223  4e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.06 
 
 
526 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  28.31 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30.84 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.49 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.23 
 
 
478 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.55 
 
 
483 aa  219  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30.75 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.29 
 
 
495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  30.55 
 
 
441 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  31.2 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  28.74 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  27.52 
 
 
490 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30 
 
 
483 aa  213  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.03 
 
 
485 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 
490 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  28.6 
 
 
477 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  26.88 
 
 
477 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.19 
 
 
486 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  26.88 
 
 
477 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 
491 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  31.79 
 
 
478 aa  206  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  28.31 
 
 
481 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  29.64 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  27.77 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  28.37 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 
474 aa  200  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  27.65 
 
 
497 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  27.07 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.98 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  27.19 
 
 
479 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.46 
 
 
481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  26.8 
 
 
473 aa  196  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  27.75 
 
 
479 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  27.41 
 
 
479 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 
479 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  28.14 
 
 
484 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  27.93 
 
 
481 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0150  cardiolipin synthetase, putative  30.18 
 
 
509 aa  192  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.926431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  26.54 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  26.39 
 
 
479 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>