39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1686 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1686  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  724    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0479604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1704  hypothetical protein  90.78 
 
 		 359 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  83.1 
 
 		 357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2811  hypothetical protein  48.6 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  38.14 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6277  hypothetical protein  32.05 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4891  hypothetical protein  28.04 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5379  putative 3-carboxymuconate cyclase  29.6 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  39.18 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.91 
 
 		 521 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.02 
 
 		 522 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  25.55 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  25.55 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  25.55 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  25.55 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  25.55 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  24.22 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  24.5 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  20.46 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  20.46 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  24.22 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  26.05 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  23.1 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  25.68 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  25.71 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  25.4 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  26.27 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  25.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  25.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  25.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  25.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  24.42 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  22.94 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  25.64 
 
 		 3222 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  24.44 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  21.78 
 
 		 3230 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  21.89 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>