More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1160 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1140    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  34.64 
 
 		 557 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.03 
 
 		 558 aa  317  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.7 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  31.22 
 
 		 521 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30.82 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.33 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.33 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  30.5 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.3 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  29.76 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  38.03 
 
 		 596 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.91 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.19 
 
 		 605 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.3 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.56 
 
 		 610 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.19 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  28.98 
 
 		 595 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  28.98 
 
 		 595 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.38 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.41 
 
 		 590 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.75 
 
 		 607 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 590 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.94 
 
 		 610 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.55 
 
 		 615 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.81 
 
 		 597 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.81 
 
 		 597 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.62 
 
 		 626 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.81 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.6 
 
 		 618 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.28 
 
 		 624 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 793 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.47 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.24 
 
 		 597 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  26.26 
 
 		 902 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.69 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 817 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 860 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.17 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  26.15 
 
 		 601 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.52 
 
 		 243 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 874 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.55 
 
 		 868 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  26.07 
 
 		 848 aa  95.1  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 897 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 918 aa  94.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 		 848 aa  94  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 857 aa  93.6  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  28.77 
 
 		 823 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 884 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 884 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 903 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 846 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 869 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 		 868 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  26.04 
 
 		 881 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 891 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 846 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 891 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 939 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 939 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 939 aa  91.3  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  25.09 
 
 		 939 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  27.3 
 
 		 819 aa  90.9  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 		 917 aa  90.9  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 893 aa  90.5  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  26.56 
 
 		 883 aa  90.1  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 885 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 886 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 860 aa  90.1  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 938 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 870 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 870 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  27.31 
 
 		 855 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  25.58 
 
 		 840 aa  89.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.27 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  30.45 
 
 		 873 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 853 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  26.55 
 
 		 881 aa  89.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 859 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 862 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 871 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 853 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 885 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  26.38 
 
 		 885 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 		 885 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 892 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  32.72 
 
 		 685 aa  87.4  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 896 aa  87.4  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  23.6 
 
 		 882 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 		 885 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 853 aa  87  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 853 aa  87  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  27.24 
 
 		 853 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>