More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1814 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  100 
 
 
436 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  62 
 
 
400 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  43.44 
 
 
503 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  42.77 
 
 
495 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  43.75 
 
 
465 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  41.26 
 
 
516 aa  339  5e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  63.27 
 
 
503 aa  211  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.44 
 
 
394 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  27.23 
 
 
418 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  26.75 
 
 
412 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  25.64 
 
 
475 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  24.64 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  23.64 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  26.77 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  23.49 
 
 
429 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  27.44 
 
 
431 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  26.39 
 
 
417 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  37.41 
 
 
490 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.9 
 
 
391 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  37.59 
 
 
430 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.24 
 
 
382 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.67 
 
 
397 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.35 
 
 
394 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  24.29 
 
 
404 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.51 
 
 
387 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.17 
 
 
374 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.43 
 
 
397 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.62 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.52 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.23 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  24.38 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  22.07 
 
 
374 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.02 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.95 
 
 
373 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.7 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.95 
 
 
372 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  26.17 
 
 
375 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.23 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  25 
 
 
441 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  23.29 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  23.86 
 
 
376 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.87 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  22.95 
 
 
387 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.83 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.89 
 
 
456 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  25.53 
 
 
428 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.04 
 
 
456 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.36 
 
 
456 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  21.31 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.61 
 
 
404 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  38.79 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.52 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  24.77 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.12 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.25 
 
 
303 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.87 
 
 
314 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  24.24 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.52 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  23.69 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  23.27 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  40.74 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  24.55 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  21.8 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.21 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  22.6 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.65 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.89 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.93 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  36.89 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  23.63 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  21.68 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  22.11 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  23.63 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  23.63 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  23.63 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  23.63 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  22.65 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  23.4 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  23.63 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  23.4 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.16 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  23.63 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  27.27 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  27.9 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  22.39 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.27 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  23.76 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  24.48 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  35.56 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  21.58 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  22.75 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  30.36 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  33.83 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  35.29 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  33.63 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>