More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2008 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  87.23 
 
 
239 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  87.66 
 
 
236 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  85.96 
 
 
235 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  82.98 
 
 
239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  82.55 
 
 
241 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  78.72 
 
 
239 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  66.67 
 
 
235 aa  330  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  68.56 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  65.11 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  63.25 
 
 
237 aa  321  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  66.67 
 
 
235 aa  320  9.000000000000001e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  65.09 
 
 
251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  65.09 
 
 
251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  65.09 
 
 
251 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  62.5 
 
 
239 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  63.36 
 
 
239 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  62.82 
 
 
239 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  63.68 
 
 
235 aa  316  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  63.36 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  64.94 
 
 
249 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  62.07 
 
 
239 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  63.79 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.36 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.77 
 
 
241 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.77 
 
 
241 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  62.93 
 
 
240 aa  307  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  62.39 
 
 
235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  58.12 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  61.37 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  61.9 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  60.52 
 
 
239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  60.26 
 
 
239 aa  300  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  61.47 
 
 
242 aa  298  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  60.34 
 
 
245 aa  298  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  61.47 
 
 
242 aa  298  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  59.48 
 
 
274 aa  298  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.31 
 
 
237 aa  297  8e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.66 
 
 
236 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  57.69 
 
 
236 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  59.91 
 
 
240 aa  295  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  58.8 
 
 
238 aa  295  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  59.83 
 
 
238 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  60.09 
 
 
240 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  60.61 
 
 
238 aa  294  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  60.34 
 
 
242 aa  294  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  59.66 
 
 
240 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.55 
 
 
240 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  62.55 
 
 
239 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  60.09 
 
 
239 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.44 
 
 
245 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  59.74 
 
 
242 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  60.26 
 
 
238 aa  291  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  58.87 
 
 
237 aa  291  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  59.23 
 
 
240 aa  291  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.51 
 
 
237 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.37 
 
 
245 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  59.4 
 
 
238 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  289  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  58.62 
 
 
243 aa  288  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.2 
 
 
239 aa  288  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  59.4 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  59.4 
 
 
239 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.76 
 
 
286 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  60.09 
 
 
239 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  56.41 
 
 
237 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  56.41 
 
 
237 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.84 
 
 
237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  56.9 
 
 
242 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  56.41 
 
 
238 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  58.97 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  57.87 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  59.23 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  56.9 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.51 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  57.33 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  57.76 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  59.15 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  56.9 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  55.13 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  56.9 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  56.41 
 
 
234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.26 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  56.41 
 
 
234 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  57.33 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  55.08 
 
 
241 aa  281  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>