More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1685 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 378 aa  775    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  48.94 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  49.2 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  49.2 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  49.2 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  48.13 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  47.37 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  48.67 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  48.4 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  46.79 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  47.33 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  48.53 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  47.61 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  49.6 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  46.83 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  47.88 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  46.77 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  49.73 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  48.57 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  46.42 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  47.61 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  47.73 
 
 		 384 aa  362  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1758  cystathionine gamma-lyase  46.56 
 
 		 379 aa  359  4e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  45.36 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  47.62 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4111  cystathionine beta-lyase  46.82 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.17 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  45.66 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 		 378 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  46.53 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  46.53 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  46.54 
 
 		 380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  47.09 
 
 		 384 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4159  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4008  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4481  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.655918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4277  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1990  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.916692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3998  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  50.89 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1804  cystathionine beta-lyase  50.28 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.699729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  43.95 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  46.17 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0766  cystathionine beta-lyase  47.88 
 
 		 378 aa  345  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  43.39 
 
 		 381 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 398 aa  339  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  47.03 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  44.18 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0406  cystathionine gamma-synthase  47.29 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0416  cystathionine gamma-synthase  47.29 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  45.12 
 
 		 379 aa  335  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.82 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.55 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.88 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.07 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0036  trans-sulfuration enzyme family protein  44.27 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 380 aa  332  6e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  46.76 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.02 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  44.74 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  43.12 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  44.59 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  43.87 
 
 		 377 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.44 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  45.09 
 
 		 383 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 389 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  41.95 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  41.64 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 394 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1762  methionine gamma-lyase (L-methioninase)  44.71 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000846941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3997  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  45.33 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 370 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>