More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1533 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 570 aa  673    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 570 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 588 aa  1199    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 570 aa  678    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 570 aa  651    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 574 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 560 aa  382  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 557 aa  360  5e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 561 aa  360  5e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 569 aa  353  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 573 aa  350  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 634 aa  333  5e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 574 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 590 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 569 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 569 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 587 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 569 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 569 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 569 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 557 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 794 aa  183  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  30.4 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 556 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 569 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 582 aa  180  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 552 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 573 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 555 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 540 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 579 aa  177  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 609 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 556 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 560 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 816 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 556 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 563 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 558 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  173  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 565 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  31.85 
 
 		 858 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>