More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0877 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0877  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2323  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.45 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1046  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.93 
 
 
292 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2146  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.56 
 
 
286 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.287177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.05 
 
 
294 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.5 
 
 
296 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.014061  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.28 
 
 
291 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4255  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  25.52 
 
 
298 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.47 
 
 
289 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.86 
 
 
289 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4346  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  25.52 
 
 
298 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4411  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  25.52 
 
 
298 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.89 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4300  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  25.52 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1915  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.06 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5498  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.45 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2308  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.7 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.17 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.45 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.21 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1979  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.82 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  26.76 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45774  predicted protein  24.38 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  26.92 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.65 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4826  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.06 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5629  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.76 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.865293  normal  0.0329981 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  26.92 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1328  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.82 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000219752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  24.91 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.03 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.92 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1322  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.67 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3216  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.33 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.969854  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.96 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.44 
 
 
284 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.24 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.87 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.52 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3712  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.76 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4656  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.76 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4233  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  24.83 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  25 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  27.21 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.32 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.69 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.53 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.06 
 
 
290 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
296 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.2 
 
 
296 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  25.27 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.74 
 
 
286 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
296 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  24.2 
 
 
296 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2461  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.5 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.6727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.69 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.69 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.87 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  24.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.95 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5125  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.05 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.41 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.57 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.74 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5817  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.39 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0885665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.57 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2159  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.72 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.57 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6723  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.04 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.57 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  23.83 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2619  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.01 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000383658  hitchhiker  0.000000335246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.82 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3332  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.37 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.48 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.67 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.02 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.48 
 
 
296 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  24.56 
 
 
294 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0635  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.78 
 
 
292 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2511  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.8 
 
 
290 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380977  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.18 
 
 
299 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4104  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.83 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.78 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.15 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3256  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.47 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0657335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>