242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1022 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  38.34 
 
 		 1285 aa  749    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  63.99 
 
 		 1250 aa  1639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  35.67 
 
 		 1239 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  39.08 
 
 		 1293 aa  741    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  34.13 
 
 		 1229 aa  684    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  37.54 
 
 		 1192 aa  709    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  36.55 
 
 		 1266 aa  726    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  36.57 
 
 		 1270 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  100 
 
 		 1250 aa  2559    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  31.83 
 
 		 1291 aa  628  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.33 
 
 		 1152 aa  592  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  32.18 
 
 		 1244 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  32.88 
 
 		 1259 aa  548  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  32.65 
 
 		 1258 aa  548  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  32.71 
 
 		 1426 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  33.92 
 
 		 1409 aa  532  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  31.38 
 
 		 1256 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  32.95 
 
 		 1406 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  33.06 
 
 		 1237 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.82 
 
 		 1302 aa  510  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.33 
 
 		 1220 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  34.15 
 
 		 1191 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  31 
 
 		 1298 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1222 aa  506  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  34.9 
 
 		 1207 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.52 
 
 		 1263 aa  502  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  34.36 
 
 		 1206 aa  502  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  32.32 
 
 		 1273 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  30.91 
 
 		 1255 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  35.29 
 
 		 1193 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  29.52 
 
 		 1247 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  34.47 
 
 		 1190 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  32.22 
 
 		 1205 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  29.77 
 
 		 1247 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31.17 
 
 		 1288 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  33.24 
 
 		 1207 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  32.83 
 
 		 1222 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.9 
 
 		 1290 aa  493  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.88 
 
 		 1194 aa  492  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  31.43 
 
 		 1213 aa  489  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  30.58 
 
 		 1444 aa  489  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  30.17 
 
 		 1304 aa  486  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  32.19 
 
 		 1253 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  33.55 
 
 		 1247 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  33.39 
 
 		 1281 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  29.66 
 
 		 1244 aa  483  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  33.92 
 
 		 1249 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  32.41 
 
 		 1198 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  32.51 
 
 		 1238 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  32.5 
 
 		 1198 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  32.5 
 
 		 1198 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  33.39 
 
 		 1281 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  33.3 
 
 		 1281 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  28.89 
 
 		 1261 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  31.72 
 
 		 1269 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  31.83 
 
 		 1266 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  31.33 
 
 		 1273 aa  476  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  31.32 
 
 		 1263 aa  476  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  33.43 
 
 		 1199 aa  475  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  31.24 
 
 		 1263 aa  473  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  33.17 
 
 		 1209 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  30.52 
 
 		 1293 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  32.02 
 
 		 1260 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  32.25 
 
 		 1269 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.25 
 
 		 1203 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  34.53 
 
 		 1220 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  31.63 
 
 		 1270 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  31.56 
 
 		 1267 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  31.66 
 
 		 1269 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  30.46 
 
 		 1253 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.39 
 
 		 1212 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  32.45 
 
 		 1269 aa  466  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  31.62 
 
 		 1270 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  34.53 
 
 		 1220 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  34.63 
 
 		 1220 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  34.53 
 
 		 1220 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  31.63 
 
 		 1257 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  31.06 
 
 		 1364 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  32.2 
 
 		 1269 aa  463  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  32.52 
 
 		 1196 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  32.2 
 
 		 1269 aa  463  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  31.23 
 
 		 1254 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  30 
 
 		 1263 aa  459  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  30.87 
 
 		 1254 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  32.63 
 
 		 1278 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  32.53 
 
 		 1240 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  32.3 
 
 		 1235 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  28.37 
 
 		 1329 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  28.95 
 
 		 1330 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  31.21 
 
 		 1248 aa  446  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  28.95 
 
 		 1330 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  28.02 
 
 		 1333 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  27.57 
 
 		 1551 aa  443  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  28.56 
 
 		 1330 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  27.92 
 
 		 1328 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  28.49 
 
 		 1341 aa  432  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  28.37 
 
 		 1758 aa  432  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  29.74 
 
 		 2110 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.49 
 
 		 1187 aa  428  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.67 
 
 		 1187 aa  430  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>