More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0717 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0932  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  77.91 
 
 
431 aa  690    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0994  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  76.74 
 
 
431 aa  682    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0283797  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0861  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  77.67 
 
 
431 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.10335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0717  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  892    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.213331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1380  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  67.05 
 
 
433 aa  599  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0438  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  65.81 
 
 
431 aa  590  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000382192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1548  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  64.65 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0633962  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0105  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1059  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
432 aa  502  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0217946  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
464 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
477 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
486 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
469 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
482 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
488 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
488 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
466 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
465 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
467 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
491 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
466 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
490 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
466 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
479 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
485 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
469 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
485 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
494 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
463 aa  250  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
467 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
469 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
484 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
469 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
482 aa  248  1e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
469 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
469 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
490 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
480 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
491 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
467 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
469 aa  246  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
473 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0680  Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ic, catalytic domain protein  34.49 
 
 
380 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
504 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
504 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
504 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
493 aa  243  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
491 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
512 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
469 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
469 aa  242  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  31.55 
 
 
546 aa  242  7e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
473 aa  242  9e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
500 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
469 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
485 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
484 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
484 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
465 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
465 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
468 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
464 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
465 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
491 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
468 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
463 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
469 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
477 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
508 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
469 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
482 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
463 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
463 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
488 aa  236  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>