More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0994 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0994  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  885    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0283797  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0932  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  96.75 
 
 
431 aa  830    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0861  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  97.91 
 
 
431 aa  840    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.10335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0717  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  76.74 
 
 
431 aa  702    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.213331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0438  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  67.82 
 
 
431 aa  610  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000382192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1548  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  65.97 
 
 
431 aa  592  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0633962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1380  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 
433 aa  585  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0105  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
429 aa  522  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1059  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 
432 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0217946  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
464 aa  297  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
469 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
488 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
486 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
477 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
466 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
469 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
469 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
482 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
469 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
466 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
469 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
469 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
465 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
469 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
469 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
478 aa  257  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
469 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
485 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0680  Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ic, catalytic domain protein  35.88 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
482 aa  253  3e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
490 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
467 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
470 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
467 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
467 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
485 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
491 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
464 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
494 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
469 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
484 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
463 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
463 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
469 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
469 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
473 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
464 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
470 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
465 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
464 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
490 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
469 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
467 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
463 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
504 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
469 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
504 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 
501 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
504 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
469 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
500 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
494 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
465 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
484 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
484 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
474 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
475 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
473 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
490 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
463 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
485 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
485 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
465 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
512 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
469 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
473 aa  235  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
469 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>