More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1059 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1059  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
432 aa  884    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0217946  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0717  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
431 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.213331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0438  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 
431 aa  495  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000382192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1548  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
431 aa  491  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0633962  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0861  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
431 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.10335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0932  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
431 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0994  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 
431 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0283797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1380  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
433 aa  481  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0105  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
429 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347504  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0680  Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ic, catalytic domain protein  36.81 
 
 
380 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
466 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 
471 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
466 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
469 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
494 aa  245  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
464 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
477 aa  243  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
485 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
465 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
501 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
488 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
469 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
469 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
481 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
469 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
467 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
469 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
472 aa  239  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 
491 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
467 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
467 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
463 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
512 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
459 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
459 aa  237  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
469 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
504 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
467 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
493 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
469 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
490 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
478 aa  234  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
465 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
470 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
469 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
465 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
471 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
471 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
464 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
490 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
473 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
469 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  34.14 
 
 
495 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 
500 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
473 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
469 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
468 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
485 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  34 
 
 
469 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
469 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
468 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
471 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
474 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
463 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  32 
 
 
469 aa  229  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
463 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
463 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>