43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1210 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  47.56 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  48.61 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  51.35 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  39.73 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  48.05 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  43.84 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  40.26 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  38.46 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  39.73 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  38.89 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  43.59 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  39.51 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  36.49 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  35.21 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  38.36 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  39.19 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  38.36 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  37.97 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  40.54 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  41.67 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  37.33 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  40.28 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  40.58 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  33.78 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  39.47 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  34.38 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  34.52 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  41.18 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  43.75 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  34.21 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.18 
 
 		 300 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.62 
 
 		 320 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  32.86 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  27.69 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  40.62 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  39.71 
 
 		 297 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  28.71 
 
 		 109 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  39.71 
 
 		 299 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  39.71 
 
 		 299 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  41.67 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>