149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3014 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  100 
 
 
519 aa  1048    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  40.2 
 
 
530 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  41.07 
 
 
540 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  43.42 
 
 
499 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  41.29 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  40.86 
 
 
541 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  41.84 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  41.78 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  40.7 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  37.55 
 
 
544 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  40.75 
 
 
537 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  39.61 
 
 
560 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  43.09 
 
 
552 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  38.74 
 
 
530 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  37.55 
 
 
537 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  40.66 
 
 
541 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  40.59 
 
 
534 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  37.55 
 
 
533 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  35.77 
 
 
587 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  38.41 
 
 
530 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  36.24 
 
 
531 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  37.57 
 
 
558 aa  346  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  37.6 
 
 
520 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  36.01 
 
 
517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  35.83 
 
 
517 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  37.6 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  33.47 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  33.47 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  33.47 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  33.47 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  33.47 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  34.02 
 
 
500 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  33.33 
 
 
500 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  33.14 
 
 
500 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  33.33 
 
 
500 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  37.34 
 
 
512 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  34.35 
 
 
524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  34.35 
 
 
524 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  34.16 
 
 
524 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  34.41 
 
 
524 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  34.62 
 
 
633 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  34.16 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  32.5 
 
 
589 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  38.96 
 
 
496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  31.55 
 
 
511 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  34.62 
 
 
473 aa  302  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  33.6 
 
 
578 aa  300  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  39.16 
 
 
495 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  34.16 
 
 
478 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  34.16 
 
 
478 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  34.16 
 
 
489 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  37.96 
 
 
437 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  34.38 
 
 
489 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  34.38 
 
 
492 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  34.41 
 
 
473 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  37.75 
 
 
437 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  37.75 
 
 
437 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  33.71 
 
 
492 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  34.99 
 
 
534 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  33.21 
 
 
622 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  34.3 
 
 
492 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  34.75 
 
 
492 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  34.08 
 
 
492 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  33.4 
 
 
596 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  32.53 
 
 
592 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  33.93 
 
 
492 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  32.64 
 
 
488 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  34.18 
 
 
515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  34.71 
 
 
512 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  36.5 
 
 
454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  35.18 
 
 
512 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  33.18 
 
 
599 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  33.88 
 
 
512 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  33.66 
 
 
531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  34.74 
 
 
512 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  34.74 
 
 
512 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  34.74 
 
 
512 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  33.11 
 
 
504 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  34.74 
 
 
512 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  30.44 
 
 
504 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  30.04 
 
 
511 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  34.52 
 
 
512 aa  266  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  32.39 
 
 
502 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  33.05 
 
 
525 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  32.67 
 
 
492 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  32.22 
 
 
492 aa  263  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  32.38 
 
 
497 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  36.79 
 
 
499 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  36.24 
 
 
499 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  37.84 
 
 
481 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  36.12 
 
 
499 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  32.29 
 
 
503 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  34.83 
 
 
754 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  34.83 
 
 
735 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  34.83 
 
 
747 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  34.83 
 
 
747 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  34.83 
 
 
652 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  34.56 
 
 
734 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  33.33 
 
 
455 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  34.56 
 
 
773 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>