More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2198 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  34.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  37.21 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  33.04 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.8 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  36.97 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  38.24 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  39.1 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.88 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.17 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  35.38 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.4 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 173 aa  76.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.83 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  30.3 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.83 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  36.27 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.5 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  27.83 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  34.96 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  34.96 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
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NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
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NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  28.1 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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