22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4143 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  701    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  30.12 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  34.22 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  28.83 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  28.77 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  29.19 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  29.33 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  29.32 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  28.26 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  27.62 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  26.99 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  26.38 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  27.48 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  25.16 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  30.86 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  27.71 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  26.87 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  27.18 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  24.91 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  27.83 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>