32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3989 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  349  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  59.2 
 
 
172 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  57.95 
 
 
173 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  51.15 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  51.69 
 
 
175 aa  178  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  53.12 
 
 
172 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  55.41 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  53.25 
 
 
171 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  53.64 
 
 
170 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  50.88 
 
 
172 aa  167  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  49.68 
 
 
171 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  48.81 
 
 
175 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  48.81 
 
 
175 aa  158  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  51.55 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  37.8 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  37.8 
 
 
170 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  37.8 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  41.89 
 
 
171 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  40 
 
 
170 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  44.92 
 
 
192 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  37.2 
 
 
170 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  36.59 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  35.98 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  37.95 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  33.99 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  35.66 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  35.51 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  32.89 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  34.91 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 
509 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  28.17 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>