122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3523 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  100 
 
 		 338 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  36.19 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  35.89 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  31.56 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  29.86 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  28.98 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  32.11 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  31.01 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  29.23 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  29.72 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  26.95 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  30.53 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  30.26 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.81 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  29.54 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  29.47 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  29.03 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  29.03 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  29.03 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  29.62 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  30 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  29.66 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  28.87 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  27.33 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  28.16 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  26.41 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  24.85 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  25.23 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  29.5 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  28.62 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  25.35 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  27.68 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  28.76 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  28.97 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  27.15 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  29.03 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  28.71 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  30.92 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  29.51 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  28.33 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  29.02 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  30.21 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  29.47 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  23.08 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  28.87 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  26.76 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  28.08 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  27.06 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  29.51 
 
 		 436 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  26.76 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  29.27 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  26.47 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  26.47 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  26.47 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  26.75 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  28.86 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  26.85 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  24.66 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  24.03 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  24.32 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  24.32 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  27.89 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  22.99 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  21.47 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  22.58 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  30 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  20.35 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.71 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  26.39 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  26.01 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  25.34 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.43 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  25.26 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  22.87 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  24.83 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  24.48 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  24.47 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  24.48 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  24.48 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  24.48 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  24.65 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  25.28 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  25.84 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  23.85 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3962  Beta-lactamase  27.53 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4487  Beta-lactamase  24.81 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  24.13 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4029  Beta-lactamase  24.79 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  26.09 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  24.43 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1245  Beta-lactamase  25.51 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.694796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>