More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2960 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2960  putrescine carbamoyltransferase  100 
 
 
349 aa  724    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1142  putrescine carbamoyltransferase  66.97 
 
 
336 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0654  putrescine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
365 aa  375  1e-103  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.889245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0670  putrescine carbamoyltransferase  49.08 
 
 
341 aa  325  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000365109  hitchhiker  0.0000131394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3447  ornithine carbamoyltransferase  48.41 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12530  putrescine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
351 aa  293  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.797625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
313 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0676  putrescine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
346 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208012  normal  0.0438433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2191  putrescine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
347 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
309 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
314 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
307 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
316 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
306 aa  268  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  43.18 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
316 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
316 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 
301 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
312 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
302 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 
305 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 
303 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  42.28 
 
 
323 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  42.21 
 
 
316 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  42.21 
 
 
316 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  42.21 
 
 
316 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 
316 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 
303 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 
304 aa  260  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 
309 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 
355 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  43.99 
 
 
313 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
313 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  44.93 
 
 
304 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  44.93 
 
 
304 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
305 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  44.57 
 
 
304 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  41.27 
 
 
316 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  43.08 
 
 
334 aa  252  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
313 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
312 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  40.66 
 
 
308 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  43.53 
 
 
313 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
323 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  44.84 
 
 
312 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  41.97 
 
 
309 aa  249  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4137  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
322 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 
308 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
320 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  42.77 
 
 
313 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  42.09 
 
 
307 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  44.28 
 
 
309 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
332 aa  245  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 
304 aa  245  9e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2766  ornithine carbamoyltransferase  41.37 
 
 
306 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.821483  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 
305 aa  242  6e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 
312 aa  242  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  40.2 
 
 
305 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  40.78 
 
 
303 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
299 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  41.1 
 
 
308 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  44.65 
 
 
334 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  41.9 
 
 
306 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 
308 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
303 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
312 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
298 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
300 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
317 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
309 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  43.45 
 
 
338 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  40.45 
 
 
303 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  40.58 
 
 
304 aa  238  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  43.05 
 
 
305 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
319 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
312 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 
312 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
302 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
312 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
305 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  40.78 
 
 
303 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  41.56 
 
 
303 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
312 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
312 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3190  ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 
312 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>