64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2806 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  44.33 
 
 
220 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.49 
 
 
238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  39.81 
 
 
238 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  35.45 
 
 
240 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0183  hypothetical protein  33.79 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  36.13 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  32.63 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  32.11 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  28.79 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  29.47 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  29.26 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  31.33 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  29.26 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  31.76 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.8 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  27.55 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  28.65 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  28.65 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  28.65 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  26.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  29.17 
 
 
218 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  25.6 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.63 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
235 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  27.14 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  26.38 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.92 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  26.11 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
819 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  27.69 
 
 
192 aa  45.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  25.98 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
307 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  23.58 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  25.62 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.2 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.42 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  22.58 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
218 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
218 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  28.29 
 
 
217 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.36 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>