39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0755 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  100 
 
 
154 aa  299  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  68.38 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  64.47 
 
 
155 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  62.5 
 
 
155 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  57.24 
 
 
161 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  62.94 
 
 
155 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  67.97 
 
 
128 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  52.34 
 
 
157 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  47.06 
 
 
166 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  49.63 
 
 
175 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  43.26 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  53.91 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  43.2 
 
 
154 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  57 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  41.67 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  42.4 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  42.4 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  36.24 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  38.13 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  37.21 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  37.9 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  34.81 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  39.34 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  38.21 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  35.29 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  37.5 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  34.96 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  35.66 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  34.88 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  41.74 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  28.68 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  32.35 
 
 
152 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  27.45 
 
 
738 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  28.57 
 
 
738 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  35.16 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  35.16 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  34.78 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>