82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1466 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1466  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.57106  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  43.04 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0296  glutaredoxin 2  46.05 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000275189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0398  glutaredoxin 2  42.31 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00666696  normal  0.622965 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1785  hypothetical protein  46.88 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0365  glutaredoxin 2  36.36 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000109433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4442  glutaredoxin 2  39.19 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  40 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2901  glutaredoxin 2  37.66 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856913  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24300  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  39.19 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.814648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3097  glutaredoxin 2  35.9 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0492  glutaredoxin 2  37.97 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3684  glutaredoxin 2  42.37 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.796183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02830  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  32.89 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.885715  normal  0.925164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2173  glutaredoxin 2  34.72 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.217575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3139  glutaredoxin 2  42.37 
 
 
81 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2844  putative glutaredoxin  34.72 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2782  putative glutaredoxin  34.72 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2812  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2469  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1792  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0540  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3298  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0546  glutaredoxin 2  36 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.700323  normal  0.323403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1011  glutaredoxin 2  34.72 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433464  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0351  glutaredoxin 2  35.14 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6734  glutaredoxin 2  33.77 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1727  hypothetical protein  31.65 
 
 
84 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0259  glutaredoxin 2  33.77 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4830  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4820  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1951  glutaredoxin 2  36.11 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5244  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5697  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.411683  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2735  putative redoxin  37.66 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5290  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5255  glutaredoxin family protein  38.98 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6133  glutaredoxin 2  30.38 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2964  glutaredoxin 2  38.6 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  33.78 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1750  glutaredoxin 2  34.92 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  40.38 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2648  glutaredoxin 2  32 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1007  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
78 aa  47.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4243  glutaredoxin 2  31.94 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1089  glutaredoxin 2  31.94 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1131  glutaredoxin 2  31.94 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4220  glutaredoxin 2  38.46 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0651  glutaredoxin 2  31.94 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0483  glutaredoxin 2  31.08 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5226  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 
81 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4991  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 
81 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5371  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 
81 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35557  predicted protein  37.66 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.356085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4933  glutaredoxin 2  35.59 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0421  glutaredoxin 2  32.43 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212488  hitchhiker  0.00541583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  35.59 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0918  glutaredoxin 2  32.89 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0838  glutaredoxin 2  30.99 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1082  hypothetical protein  34.92 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  31.08 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2316  glutaredoxin 2  28.99 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10519  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4582  glutaredoxin 2  30.88 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.905173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  28.57 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3278  glutaredoxin 2  31.65 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  30 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  31.15 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0241  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00557847  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  33.33 
 
 
95 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0989  glutaredoxin 2  35.71 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2739  glutaredoxin 2  31.33 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454168  normal  0.0483416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2902  glutaredoxin 2  31.25 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22816  normal  0.456147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4152  glutaredoxin 2  32.2 
 
 
91 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.128029  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0924  glutaredoxin 2  30 
 
 
91 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0919306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0517  glutaredoxin 2  30 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000069549  hitchhiker  0.000415643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0688  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.221037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0668  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.92813  normal  0.901125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0675  glutaredoxin 2  28.57 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0615  glutaredoxin 2  24.32 
 
 
103 aa  40.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0309073  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  31.17 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  36.54 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>