150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0668 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  100 
 
 
377 aa  771    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.02 
 
 
411 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  34.39 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  30.19 
 
 
411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  29.17 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.66 
 
 
369 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  32.54 
 
 
351 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.8 
 
 
348 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.15 
 
 
374 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  30.36 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.12 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.52 
 
 
420 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  28.09 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  28.89 
 
 
367 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  27.78 
 
 
367 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  28.89 
 
 
367 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  28.78 
 
 
367 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  28.41 
 
 
367 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  28.41 
 
 
367 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  27.49 
 
 
536 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  28.41 
 
 
367 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  33.64 
 
 
411 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  33.64 
 
 
411 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.49 
 
 
314 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  32.73 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  28.04 
 
 
367 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  27.78 
 
 
367 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.97 
 
 
337 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.34 
 
 
588 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  30.1 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  25.21 
 
 
672 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  31.98 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.79 
 
 
368 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.71 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  27.48 
 
 
378 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.01 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  32 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  23.38 
 
 
373 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.62 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.91 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.52 
 
 
607 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  36.16 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.06 
 
 
493 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  27.54 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.06 
 
 
493 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  31.58 
 
 
710 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.21 
 
 
483 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.97 
 
 
397 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  28.4 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.6 
 
 
325 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  22.11 
 
 
372 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  23.08 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  35.63 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.07 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  26.36 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  29.33 
 
 
712 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  27.71 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  24.79 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.37 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.3 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.41 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.92 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  23.11 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.73 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  28.77 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  26.43 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.99 
 
 
464 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.91 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  27.75 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.04 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.69 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  27.65 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  22.5 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  27.67 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  24.73 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  26.6 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  25.78 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  27.83 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  23.67 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  27.34 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  26.67 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.71 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  27.78 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  30.52 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  25.87 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  28.08 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.73 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  26.21 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.36 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  21.49 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  25.68 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  24.03 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.51 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  30.51 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3999  Capsule synthesis protein, CapA  22.8 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0396426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  25.11 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  30.51 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  27.38 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  25.94 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  26.67 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>