68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6013 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  38.19 
 
 
353 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  36.66 
 
 
367 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  34.44 
 
 
412 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  33.44 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  30.9 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  27.12 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  29.7 
 
 
352 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  33.96 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  31.08 
 
 
378 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  31.74 
 
 
373 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  30.03 
 
 
369 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  24.55 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  30.82 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  29.6 
 
 
383 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  32.2 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  31.12 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  32.57 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  28.96 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  31.91 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  22.8 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  27.36 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  30.89 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  33.01 
 
 
404 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  31.09 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  33.44 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  30.13 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  33.13 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  27.94 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  28.44 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  29.75 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  27.36 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  30.45 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  32.34 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  27.5 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  30.84 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  27.17 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  29.24 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  27.63 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  30.53 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  28.7 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  30.14 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  28.53 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  27.78 
 
 
372 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  29.05 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  23.44 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  32.96 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  29.86 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  27.19 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  27.76 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  26.49 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  31.63 
 
 
378 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  28.74 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  27.61 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  28.96 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  32.5 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  26.76 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  32.35 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  30.2 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  27.6 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  30.41 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  25.84 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  26.4 
 
 
355 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  26.4 
 
 
355 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  37.1 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11032  Mst3-like protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02220)  38.1 
 
 
580 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.148094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>