83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5304 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  61.35 
 
 		 249 aa  304  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  59.15 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  58.87 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  58.87 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  58.44 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  57.58 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  53.81 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  51.26 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  53.33 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  50.21 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  50.21 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  51.39 
 
 		 163 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  29.39 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  27.92 
 
 		 411 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  22.53 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.88 
 
 		 576 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.88 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  24.64 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  25.12 
 
 		 571 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 407 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.74 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  22.27 
 
 		 407 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 395 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 399 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.96 
 
 		 582 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.99 
 
 		 394 aa  52.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 407 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.44 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  26.06 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 		 402 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  26.06 
 
 		 406 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 398 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 401 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.32 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.21 
 
 		 574 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.96 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.96 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 396 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.12 
 
 		 503 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  21.3 
 
 		 407 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 		 402 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.93 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.16 
 
 		 505 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.19 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  24.77 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.27 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  22 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.91 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 405 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.63 
 
 		 485 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.37 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  27.89 
 
 		 409 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 421 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  23.56 
 
 		 404 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  24.29 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.44 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  23.98 
 
 		 579 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.44 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  26.02 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  23.46 
 
 		 572 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  23.49 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.17 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.08 
 
 		 494 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  34.91 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.05 
 
 		 884 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  30 
 
 		 431 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>