16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0268 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  100 
 
 		 1015 aa  2023    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  33.55 
 
 		 1162 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  33.7 
 
 		 882 aa  172  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  36.06 
 
 		 368 aa  152  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  30.47 
 
 		 664 aa  128  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 943 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  31.32 
 
 		 359 aa  115  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  31.41 
 
 		 647 aa  107  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  29.25 
 
 		 735 aa  95.5  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  28.57 
 
 		 942 aa  94.7  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  29.37 
 
 		 544 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  27.82 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  80.9  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  30.87 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  26.09 
 
 		 331 aa  57.4  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 		 965 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>