15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0694 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1162 aa  2279    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  33.55 
 
 
1015 aa  305  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  32.23 
 
 
882 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  33.78 
 
 
368 aa  136  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  31.55 
 
 
664 aa  131  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 
943 aa  129  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
359 aa  124  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  31.02 
 
 
647 aa  104  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  29.33 
 
 
942 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  26.08 
 
 
735 aa  92.8  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  30.35 
 
 
750 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  29.01 
 
 
544 aa  76.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  23.78 
 
 
363 aa  74.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  27.4 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  31.01 
 
 
331 aa  71.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>