13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2462 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 942 aa  1899    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  27.12 
 
 		 882 aa  104  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 		 1162 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1015 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  26.52 
 
 		 368 aa  91.3  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  28.21 
 
 		 647 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  24.93 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  29.56 
 
 		 664 aa  67.4  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 943 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  23.72 
 
 		 735 aa  57.4  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  26.88 
 
 		 750 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  24.09 
 
 		 544 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  20.1 
 
 		 331 aa  46.2  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>