13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2986 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1241    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  42.54 
 
 
664 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  32.66 
 
 
882 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  32.55 
 
 
368 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  31.16 
 
 
1015 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 
1162 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  29.02 
 
 
942 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  31.07 
 
 
359 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 
943 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  23.88 
 
 
363 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  27.15 
 
 
331 aa  51.2  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  28.74 
 
 
750 aa  50.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  26.88 
 
 
735 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>