29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1349 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  88.05 
 
 		 544 aa  885    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  35.92 
 
 		 882 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  33.84 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  45.86 
 
 		 158 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  44.36 
 
 		 158 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1015 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.74 
 
 		 943 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  34.04 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  32.41 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  35.34 
 
 		 193 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 		 1162 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  27.4 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  32.12 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  34.11 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  30.53 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  29.45 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  26.47 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  28.82 
 
 		 750 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  33.61 
 
 		 165 aa  54.3  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  28.15 
 
 		 647 aa  47.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  27.15 
 
 		 194 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  25.19 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  24.38 
 
 		 942 aa  45.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6008  hypothetical protein  24.78 
 
 		 196 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.795639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>