10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1780 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  755    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1015 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  25.38 
 
 		 882 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  24.36 
 
 		 1162 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  24.43 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  41.11 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  24.18 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  31.03 
 
 		 735 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 943 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  22.87 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>