18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4207 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 882 aa  1708    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  52.48 
 
 		 368 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1015 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  38.07 
 
 		 359 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.04 
 
 		 943 aa  188  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  32.4 
 
 		 735 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  33.24 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  33.05 
 
 		 664 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  33.67 
 
 		 750 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  34.03 
 
 		 647 aa  137  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  34.77 
 
 		 544 aa  124  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  35.92 
 
 		 544 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  27.38 
 
 		 942 aa  114  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  25.56 
 
 		 363 aa  91.3  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  24.46 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1828  hypothetical protein  34.84 
 
 		 376 aa  55.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  21.98 
 
 		 628 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1829  hypothetical protein  36.08 
 
 		 161 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>