15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1830 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  54.68 
 
 		 882 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1015 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  35.48 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  34.07 
 
 		 1162 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.76 
 
 		 943 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  32.02 
 
 		 647 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  31.82 
 
 		 735 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  33.71 
 
 		 544 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  33.08 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  32.68 
 
 		 664 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  26.52 
 
 		 942 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  24.43 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  29.5 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  30.66 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>